Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMY2BP19961 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms