Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD53P19397 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD53P19397 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD53P19397 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD53P19397 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD53P19397 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD53P19397 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD53P19397 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms