Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZKSCAN1P17029 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZKSCAN1P17029 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZKSCAN1P17029 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZKSCAN1P17029 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZKSCAN1P17029 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZKSCAN1P17029 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZKSCAN1P17029 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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