Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR2AP13861 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR2AP13861 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms