Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMP3P12645 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMP3P12645 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMP3P12645 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMP3P12645 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BMP3P12645 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms