Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RALAP11233 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RALAP11233 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RALAP11233 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RALAP11233 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RALAP11233 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RALAP11233 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RALAP11233 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RALAP11233 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms