Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms