Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYH3P11055 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYH3P11055 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYH3P11055 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYH3P11055 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH3P11055 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH3P11055 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH3P11055 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH3P11055 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH3P11055 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH3P11055 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH3P11055 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH3P11055 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH3P11055 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms