Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM10L2BP0DMW5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM10L2BP0DMW5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms