Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGA3P0DJD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PGA3P0DJD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms