Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HSP90AB1P08238 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB1P08238 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms