Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI1P08151 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI1P08151 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI1P08151 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI1P08151 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI1P08151 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI1P08151 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI1P08151 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms