Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB1P08034 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB1P08034 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB1P08034 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB1P08034 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB1P08034 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB1P08034 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB1P08034 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB1P08034 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB1P08034 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB1P08034 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB1P08034 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms