Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM3P06753 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM3P06753 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM3P06753 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM3P06753 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM3P06753 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM3P06753 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM3P06753 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms