Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms