Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD2O96028 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD2O96028 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD2O96028 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD2O96028 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD2O96028 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD2O96028 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD2O96028 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD2O96028 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD2O96028 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD2O96028 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD2O96028 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD2O96028 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD2O96028 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD2O96028 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD2O96028 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD2O96028 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD2O96028 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD2O96028 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms