Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP4O95707 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP4O95707 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP4O95707 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP4O95707 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP4O95707 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP4O95707 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP4O95707 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP4O95707 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP4O95707 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP4O95707 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms