Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
USP19O94966 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP19O94966 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP19O94966 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP19O94966 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP19O94966 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP19O94966 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP19O94966 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP19O94966 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP19O94966 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP19O94966 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP19O94966 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP19O94966 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP19O94966 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP19O94966 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP19O94966 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms