Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SKAP2O75563 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms