Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPHP4O75161 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPHP4O75161 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms