Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4BP1O75113 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms