Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9AO75110 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms