Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRY3O43610 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms