Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP290O15078 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP290O15078 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP290O15078 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP290O15078 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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