Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
U2SURPO15042 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2SURPO15042 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms