Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN5O00501 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN5O00501 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN5O00501 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN5O00501 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN5O00501 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN5O00501 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN5O00501 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms