Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP1O00294 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms