Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM8A7E2V4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM8A7E2V4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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