Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NJR5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A6NJR5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NJR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NJR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NJR5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NJR5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms