Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP2A4UGR9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XIRP2A4UGR9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms