Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE9A4FU28 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms