Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms