Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms