Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K7

Apc2, Adenomatous polyposis coli protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apc2Q9Z1K7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apc2Q9Z1K7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apc2Q9Z1K7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apc2Q9Z1K7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apc2Q9Z1K7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apc2Q9Z1K7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apc2Q9Z1K7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apc2Q9Z1K7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apc2Q9Z1K7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms