Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms