Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Tnip1Q9WUU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Tnip1Q9WUU8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Tnip1Q9WUU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Tnip1Q9WUU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tnip1Q9WUU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tnip1Q9WUU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Tnip1Q9WUU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Tnip1Q9WUU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Tnip1Q9WUU8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Tnip1Q9WUU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Tnip1Q9WUU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Tnip1Q9WUU8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Tnip1Q9WUU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Tnip1Q9WUU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,1 ms