Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opn4Q9QXZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opn4Q9QXZ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Opn4Q9QXZ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Opn4Q9QXZ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Opn4Q9QXZ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn4Q9QXZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Opn4Q9QXZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Opn4Q9QXZ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Opn4Q9QXZ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms