Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4GQ9NTN9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEMA4GQ9NTN9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4GQ9NTN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4GQ9NTN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4GQ9NTN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms