Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cd2apQ9JLQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cd2apQ9JLQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cd2apQ9JLQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cd2apQ9JLQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cd2apQ9JLQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cd2apQ9JLQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cd2apQ9JLQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms