Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a3Q9JLI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Col5a3Q9JLI2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col5a3Q9JLI2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col5a3Q9JLI2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col5a3Q9JLI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col5a3Q9JLI2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col5a3Q9JLI2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col5a3Q9JLI2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Col5a3Q9JLI2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Col5a3Q9JLI2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col5a3Q9JLI2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col5a3Q9JLI2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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