Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akip1Q9JJR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akip1Q9JJR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akip1Q9JJR5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akip1Q9JJR5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akip1Q9JJR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Akip1Q9JJR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akip1Q9JJR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms