Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx1Q9ER42 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx1Q9ER42 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barx1Q9ER42 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barx1Q9ER42 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Barx1Q9ER42 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx1Q9ER42 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms