Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ46

Vmn1r40, Vomeronasal type-1 receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r40Q9EQ46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r40Q9EQ46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vmn1r40Q9EQ46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r40Q9EQ46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r40Q9EQ46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r40Q9EQ46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r40Q9EQ46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r40Q9EQ46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r40Q9EQ46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms