Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ly6kQ9CWP4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ly6kQ9CWP4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ly6kQ9CWP4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly6kQ9CWP4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly6kQ9CWP4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ly6kQ9CWP4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ly6kQ9CWP4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ly6kQ9CWP4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ly6kQ9CWP4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ly6kQ9CWP4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ly6kQ9CWP4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ly6kQ9CWP4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ly6kQ9CWP4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms