Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Six6os1Q9CTN5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Six6os1Q9CTN5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Six6os1Q9CTN5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Six6os1Q9CTN5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Six6os1Q9CTN5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Six6os1Q9CTN5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Six6os1Q9CTN5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Six6os1Q9CTN5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Six6os1Q9CTN5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Six6os1Q9CTN5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Six6os1Q9CTN5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Six6os1Q9CTN5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Six6os1Q9CTN5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Six6os1Q9CTN5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms