Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC77Q9BR77 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC77Q9BR77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC77Q9BR77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC77Q9BR77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC77Q9BR77 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms