Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hdac9Q99N13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hdac9Q99N13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hdac9Q99N13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hdac9Q99N13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hdac9Q99N13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac9Q99N13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hdac9Q99N13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac9Q99N13 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac9Q99N13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac9Q99N13 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hdac9Q99N13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hdac9Q99N13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac9Q99N13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac9Q99N13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac9Q99N13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hdac9Q99N13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac9Q99N13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms