Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Abtb1Q99LJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abtb1Q99LJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abtb1Q99LJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms