Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Abtb1Q99LJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abtb1Q99LJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abtb1Q99LJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abtb1Q99LJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abtb1Q99LJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abtb1Q99LJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abtb1Q99LJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abtb1Q99LJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms