Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DPF3Q92784 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DPF3Q92784 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DPF3Q92784 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DPF3Q92784 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DPF3Q92784 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DPF3Q92784 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DPF3Q92784 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DPF3Q92784 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DPF3Q92784 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DPF3Q92784 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DPF3Q92784 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DPF3Q92784 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DPF3Q92784 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms