Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Klc3Q91W40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Klc3Q91W40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Klc3Q91W40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Klc3Q91W40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Klc3Q91W40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Klc3Q91W40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Klc3Q91W40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Klc3Q91W40 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Klc3Q91W40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Klc3Q91W40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Klc3Q91W40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Klc3Q91W40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Klc3Q91W40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Klc3Q91W40 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Klc3Q91W40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Klc3Q91W40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Klc3Q91W40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Klc3Q91W40 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Klc3Q91W40 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms